Tre postdoktor-stipendier (2 år) i Proteiners biofysik
Umeå universitet satsar på kreativa miljöer för studier och arbete. Hos oss finns attraktiva utbildningar, världsledande forskning och utmärkta innovations- och samverkansmöjligheter. Fler än 4 000 medarbetare och 36 000 studenter har redan valt Umeå universitet. Välkommen med din ansökan!
Kemiskt Biologiskt Centrum (KBC, www.kbc.umu.se) vid Umeå universitet är en kreativ och interaktiv miljö som omfattar sex institutioner. Kemiska institutionen hör till KBC och har ett flertal forskare inom området proteinkemi. Dessa forskare använder biokemiska och biofysikaliska metoder för att på molekylär och mekanistisk nivå studera olika proteiner och deras egenskaper. Inom den kemiska institutionen finns utmärkt utrustning för proteinforskning, t.ex. 850 MHz NMR, röntgenutrustning samt kalorimetriska, biofysikaliska och spektroskopiska instrument. Dessutom finns goda möjligheter för molekylärbiologiskt och proteinkemiskt arbete. För att ytterligare stärka den biofysikaliska proteinforskningen erbjuder tre av forskarna postdoktorstipendier inom följande projekt:
Ett postdoktorstipendium inom området metall-transporterande proteiner, dnr 223-858-13
Forskningen i Wittung-Stafshede’s laboratorium har länge fokuserat på proteinveckning och olika metallers roll i dessa reaktioner. Pågående forskningsfrågor är hur cell-liknande miljöer påverkar proteinveckningen, hur amyloid-aggregering går till och kan styras, och hur metaller transporteras till metall-beroende proteiner via olika metalltransportsystem. Vi söker nu en stipendiat som främst ska delta i studierna av proteiner som transporterar koppar, zink och mangan. Forskargruppen har flera års erfarenhet av koppar-transporterande P1B-typ ATPaser och koppar-chaperoner. Dessa studier kommer att fortsätta, men dessutom kommer forskning på nya proteiner som transporterar andra metaller att initieras. I samtliga studier används en rad olika biofysikaliska metoder, t ex cirkulär dikroism, fluorescens, stopped-flow mixing, NMR och kalorimetri i kombination med molekylär biologi och mutagenes. Det finns flera möjliga inriktningar för forskningen och det är önskvärt att den sökande själv bidrar med egna ideer till projektets utveckling.
En framgångsrik sökande ska ha en gedigen bakgrund inom proteinbiofysik och proteinbiokemi. Teoretisk och praktisk kunskap av proteinuttryck, proteinrening samt spektroskopiska och kalorimetriska metoder är ett krav. Tidigare erfarenhet av metall-transporterande proteiner och/eller membranproteiner är meriterande.
För mer information, kontakta professor Pernilla Wittung-Stafshede, e-post: pernilla.wittung@chem.umu.se
Ett postdoktorstipendium inom området struktur-funktionsstudier av apoptosreglerande membranproteiner, dnr 223-859-13
Det övergripande målet inom denna forskningsinriktning är att förstå funktionen hos biologiska membraner – från lipidmatrisen till membranproteiner och lipid/proteinkomplex. För att nå detta mål studerar vi deras molekylära organisation på atomnivå. Vi nyttjar en rad olika biofysikaliska och biokemiska metoder, med tyngdpunkten på fastfas-NMR-spektroskopistudier av lipid/proteinkomplex. Vi är särskilt intresserade av att studera Bcl-2-familjens proteiner, vilka är inblandade i regleringen av den mitokondriella apoptosen (programmerad celldöd). Genom att tillämpa olika avancerade fastfas-NMR-tekniker har vi för avsikt att skaffa strukturell information om den underliggande molekylära mekanismen för hur överlevnadsproteinet Bcl-2 och dess motspelare, det proaptotiska Bax-proteinet, växelverkar vid mitokondriens membransystem och därigenom avgör cellens öde. Den utvalda stipendiaten kommer främst att delta i strukturbestämningen av det membranbundna Bcl-2-proteinet, samt i studierna av strukturella förändringar hos överlevnadsproteinet vid närvaron av Bax. Denna studie kommer även att innefatta proteinfunktionsstudier, bland annnat hur förekomsten av oxiderade fosfolipider (bildade vid oxidativ stress) påverkar Bcl-2. För att kunna genomföra detta projekt finns en utomordentlig forskningsinfrastruktur till hands i KBC-byggnaden, med tillgång till en 850 MHz fastfas/vätskefas-NMR-spektrometer.
Sökande till detta stipendium bör ha en gedigen forskarbakgrund inom området strukturbestämning av proteiner med fastfas- (helst) eller vätskefas-NMR. Ytterligare kunskaper inom membran- och proteinbiofysik, proteinuttryck och grundläggande biofysikaliska och spektroskopiska metoder, är önskvärda.
För mer information, kontakta professor Gerhard Gröbner, e-post:
gerhard.grobner@chem.umu.se
Ett postdoktorstipendium inom området protein-NMR, dnr 223-860-13
Forskningen i Wolf-Watz laboratorium är inriktad på att förstå makromolekylär växelverkan på nivån av mikroskopiska mekanismer, kinetik och termodynamik. Det gemensamma målet för alla delprojekt är att på en molekylär och mekanistisk nivå förstå den biologiska funktionen hos utvalda proteiner. För samtliga delprojekt finns biologiska assays etablerade.
Inriktning 1. Enzymdynamik och dess koppling till katalys. Vi använder oss av två modellenzymer; adenylatkinas och ytterligare ett kinas som verkar på ett lågmolekylärt substrat.
Inriktning 2. Struktur och dynamik hos utvalda proteiner kopplade till virulensen hos den patogena bakterien Yersinia pseudotuberculosis. Detta projekt bedrivs i gränsområdet mellan biofysik och molekylärbiologi.
Inriktning 3. Växelverkan mellan chaperoner och klientproteiner. I detta projekt är vi intresserade av att undersöka interaktionen mellan DnaJ, DnaK systemet och klientproteiner. Vi är även intresserade av funktionen hos mer specifika chaperoner.
Den primära metod som används är NMR-spektroskopi i lösning men vi använder också en rad andra biofysikaliska tekniker, aktivitetsmätningar och ”protein-engineering”-metoder. NMR-utrustningen i Umeå håller högsta klass och vi har tillgång till 500, 600 och 850 MHz-spektrometrar i vår forskning. Alla spektrometrar uppgraderades nyligen och 850 MHz-maskinen är helt ny.
Inriktningen på forskningen inom detta projekt kan påverkas av bakgrunden och intresset hos den framgångsrika kandidaten. Den sökande måste ha dokumenterad erfarenhet av lösnings-NMR applicerad på biologiska makromolekyler. Erfarenhet av proteinuttryck och -rening är ett krav, liksom en gedigen erfarenhet av proteiners biokemi eller biofysik.
För mer information kontakta universitetslektor Magnus Wolf-Watz, e-post:
magnus.wolf-watz@chem.umu.se
För samtliga stipendier:
För behörighet krävs en doktorsexamen eller motsvarande utländsk examen, som i första hand inte är äldre än tre år. Sökande måste ha kapacitet till vetenskapligt forskningsarbete och färdigheter i att skriva vetenskapliga publikationer och rapporter på engelska. Mycket goda kunskaper i engelska språket krävs, i såväl tal som skrift. Kunskaper i svenska språket är meriterande.
Samtliga stipendier gäller för två år och startar under slutet av 2013, eller vid en tidpunkt som bestäms i avtal mellan de två parterna.
En komplett ansökan ska skrivas på svenska eller engelska och innehålla: (i) ett följebrev som sammanfattar dina kvalifikationer, forskningsintressen och motiv för ansökan, (ii) en meritförteckning med publikationslista, (iii) kopior av relevanta publikationer, (iv) kopior av examensbevis, och (v) namn och aktuella kontaktuppgifter till tre referenspersoner.
Ansökan kan göras elektroniskt (MS Word eller PDF) eller i pappersformat (två kopior)
Facklig information lämnas av SACO, 090-786 53 65, SEKO, 090-786 52 96 och ST, 090-786 54 31
Om du vill söka ett stipendium inom fler än ett område, måste separata ansökningar lämnas in.
Välkommen med din ansökan, märkt med diarienumret för det stipendium du söker. Skicka den till medel@diarie.umu.se (ange Dnr som rubrik) eller till Registrator, Umeå universitet, SE-901 87 Umeå, Sverige, senast 2013-09-16.