Postdoktoralt stipendium, ett år inom peptidoglykan-kemometri
Institutionen för Molekylärbiologi erbjuder ett postdoktorsstipendium inom projektet "Systembiologiska studier av bakteriella cellväggar". Stipendiet avser ett år med tillträde i Januari 2026, eller enligt överenskommelse. Sista ansökningsdag är 22 december, 2025.
Institutionsspecifik information
Cava-laboratoriet, lokaliserat vid Laboratory of Molecular Infection Medicine Sweden (MIMS) och Institutionen för molekylärbiologi vid Umeå universitet, utgör en dynamisk och stimulerande multidisciplinär forskningsmiljö med fokus på bakteriell cellväggsbiologi och genetik. Vår forskning befinner sig i skärningspunkten mellan grundläggande och kliniska studier.
Projektbeskrivning
Vi tillämpar banbrytande systemnivåbaserade analytiska metoder som är avgörande för att besvara dessa komplexa frågeställningar. Våra preliminära resultat, vilka ligger till grund för denna ansökan, representerar ett paradigmskifte och visar att cellväggsbildning är en samordnad process som styrs av en betydande och hittills otillräckligt utforskad del av det bakteriella genomet – i en omfattning långt större än tidigare antagits. Det övergripande målet är att kartlägga hela repertoaren av genetiska determinanter för peptidoglykanbiogenes och ombyggnad i olika patogena bakterier, samt att klarlägga deras funktionella roller inom cellulära nätverk. Genom detta avser vi att fördjupa förståelsen av de fundamentala principerna som reglerar cellväggens homeostas och plasticitet, och i förlängningen främja utvecklingen av nya och mer effektiva terapier för behandling av infektionssjukdomar.
Stipendiaten kommer att få möjlighet att:
Postdoktorkandidaten kommer att ha möjlighet att kunna utveckla dedikerad mjukvara för jämförande analys av cellväggsrelaterade kromatografiska och masspektrometriska data, samt att etablera och förvalta en cellväggsdatabas.
Kvalifikationer
För att vara behörig för ett postdoktoralt stipendium ska personen ha avlagt doktorsexamen eller utländsk examen som bedöms motsvara doktorsexamen inom område molekylärbiologi, bioinformatik, kemometri, datavetenskap, maskininlärning eller närliggande områden med stark kompetens inom både statistisk analys och mjukvaruutveckling. Detta behörighetskrav ska vara uppfyllt senast vid tidpunkten då beslut om stipendiatmottagare fattas. För att vara aktuell som postdoktorstipendiat bör i första hand den komma i fråga som avlagt examen högst tre år sedan från sista ansökningsdag. Om det finns särskilda skäl kan den komma i fråga som avlagt doktorsexamen tidigare. Med särskilda skäl avses ledighet på grund av sjukdom, föräldraledighet eller klinisk tjänstgöring, förtroendeuppdrag inom fackliga arbetstagarorganisationer eller andra liknande omständigheter.
Vi söker en mycket motiverad kandidat med utmärkta kommunikativa färdigheter i engelska, både muntligt och skriftligt. Du bör vara bekväm med att arbeta i nära samarbete inom ett team, men också kunna strukturera och driva din forskning självständigt.
Den ideala kandidaten har stark kompetens inom kemometri, maskininlärning och statistisk analys – både multivariat och univariat – med hjälp av verktyg såsom R, MATLAB och Python. Erfarenhet av utveckling av beräkningsverktyg och implementering av modeller är avgörande, liksom god förståelse för mjukvaruutvecklingens bästa praxis, inklusive agila arbetsflöden, kodrefaktorering, enhetstester och mjukvaruvalidering. Kandidaten förväntas också ha erfarenhet av GitHub-baserad versionshantering och kollaborativa arbetsflöden, samt SQL för robust databashantering.
Vi värdesätter kandidater med färdigheter inom experimentdesign (DoE), klassificering, kalibrering, prediktiv modellering samt både linjära och icke-linjära modelleringsmetoder. Kompetens inom statistisk processtyrning, nätverksanalys, kausal modellering och högkapacitetsdataanalys är mycket meriterande. Ytterligare erfarenhet av datafusionsstrategier för multisensorintegration, batchbearbetning och avancerade metoder för modellutvärdering ses som en stark merit.
Slutligen betraktas expertis inom djupinlärningsramverk såsom PyTorch och TensorFlow för utveckling av neurala nätverk som en betydande fördel.
Ansökan
En fullständig ansökan bör inkludera:
Ett personligt brev som beskriver forskningserfarenhet, intressen och motivation.
Curriculum vitae (CV) med publikationslista.
Verifierad kopia av doktorsexamensintyg eller dokumentation som klargör när doktorsexamen förväntas erhållas.
Kontaktinformation till två personer som är villiga att agera som referenser.
Andra dokument som sökanden önskar åberopa.
Ansökan ska vara skriven på engelska eller svenska och bifogade dokument ska vara i Word eller pdf-format. Ansökan ska registreras via Umeå universitets e-rekryteringssystem Varbi och vara inkommen senast 22 december 2025.
