Information till studenter och medarbetare med anledning av covid-19 (Uppdaterad: 20 januari 2021)
Forskning: Modellering av transkriptionella och metaboliska nätverk i träd, med hjälp av system biologi.
Vi integrerar beräkningsmässigt experimentella högdensitets data, från transkriptom-analys, metabolomik, proteomik och sekvensinformation, till nätverksmodeller för att beskriva samverkan mellan gener, proteiner och metaboliter, och de underliggande regulatoriska kopplingarna som är fastprogrammerade i trädets genome. Våra modeller, som bygger på maskininlärnings teknik, avslöjar allmänna trender i datat, och kan även predicera nya hypoteser för ytterligare experiment. Vi siktar på att uppnå synergieffekter mellan experimentell biologi och databiologi genom iterativt använda modeller för att styra experimentalister och nya experimentella resultat för att förbättra modellerna.
För mera detaljerad information, Torgeir Hvidsten@UPSC