Praktik i bioinformatik, 15 hp

Innehåll

Den här kursen erbjuder en praktisk introduktion i forskningsaktivitet och utförs på institutionen för molekylärbiologi vid Umeå universitet. Studenten får möjligheten att införskaffa sig kunskap i bioinformatik och utveckla sin förmåga att praktiskt tillämpa kunskapen under den aktuella studieperioden. Studenten medverkar till att lösa en uppgift som är relaterad till bioinformatisk forskningsaktivitet som pågår på Umeå universitet samt dokumenterar och rapporterar de erhållna resultaten, både muntligt och genom versionshantering.

Förväntade studieresultat

Efter avklarad kurs ska studenterna kunna, med avseende på:

Kunskap och förståelse:

• visa kunskaper inom det bioinformatiska området

Färdighet och förmåga:

• visa förmåga att tillämpa teoretiska kunskaper och praktiska färdigheter

• visa förmåga att tolka erhållna resultat

• visa förmåga att självständigt redovisa resultat från projektet muntligen på engelska samt via versionshantering

Värderingsförmåga och förhållningssätt:

• förstå och värdera krav och villkor för bioinformatisk forskningsverksamhet

Behörighetskrav

20 hp från avslutade kurser, varav minst 5 hp programmering och 5 hp matematik och/eller matematisk statistik.

Undervisningens upplägg

Praktiken utförs individuellt under handledning enligt en projektplan som upprättats av handledande lärare. Studenten deltar dessutom i forskargruppens anordnade gruppverksamheter som exempelvis seminarier och journalklubb.

Undervisningsspråket är engelska men undervisningen kan ske på svenska om behovet av engelska saknas.

Examination

Kursen examineras genom följande prov:

• De praktiska aktiviteterna examineras under kursens gång genom individuella diskussioner med handledaren.

• Individuell dokumentation av kod på engelska. Koden ska hanteras genom ett versionshanteringssystem (tex Git) och versioner ska tillföras löpande enligt etablerade normer. Kod ska implementeras enligt gällande bästa praktik inom bioinformatik.

• En inspelad muntlig presentation av sitt arbete och dess utveckling. Studenterna kan presentera sitt arbete individuellt eller i grupp.

För kursen ges något av betygen Underkänd (U), Godkänd (G) eller Väl godkänd (VG). För betyget Godkänd (G) på hela kursen måste studenten fått bedömningen godkänd (G) på alla examinationer. För betyget Väl godkänd (VG) på hela kursen måste studenten fått bedömningen Väl godkänd (VG) på dokumentationen och implementationen av koden samt Godkänd (G) på resterande examinationer. Betyg på kursen beslutas först när samtliga prov är bedömda.

Studerande som ej blivit godkänd vid ordinarie tillfälle har rätt till förnyat prov, ett s.k. omprov. Det första omprovet ska erbjudas senast två månader efter det ordinarie provet, dock tidigast tio arbetsdagar efter det att resultatet av det ordinarie provet har meddelats. För prov som genomförs under maj och juni månad får första omprovet erbjudas inom tre månader efter ordinarie provtillfälle. Minst ett andra omprov (ett s.k. uppsamlingsprov) ska erbjudas inom ett år efter det ordinarie tillfället. Den som godkänts i prov får ej undergå förnyat prov för högre betyg.

En student som utan godkänt resultat har genomgått två prov för en kurs eller en del av en kurs, har rätt att få en annan examinator utsedd, om inte särskilda skäl talar emot det (HF 6 kap. 22 §). Begäran om ny examinator ställs till biträdande prefekt för institutionen för molekylärbiologi.

Examinator kan besluta om avsteg från kursplanens examinationsform. Individuell anpassning av examinationsformen ska övervägas utifrån studentens behov. Examinationsformen anpassas inom ramen för kursplanens förväntade studieresultat. Student som har behov av en anpassad examination ska senast 10 dagar innan examinationen begära anpassning hos kursansvarig institution. Examinator beslutar om anpassad examination som sedan meddelas studenten.

Övriga föreskrifter

Tillgodoräknande

Den studerande har rätt att få prövat om tidigare utbildning eller motsvarande kunskaper och färdigheter förvärvade i yrkesverksamhet kan tillgodoräknas för motsvarande utbildning vid Umeå universitet. Ansökan om tillgodoräknande skickas in till Studentcentrum. Mer information om tillgodoräknande finns på Umeå universitets studentwebb och i högskoleförordningen (6 kap).

Övergångsbestämmelser

I det fall att kursplan upphör att gälla eller genomgår större förändringar, garanteras studenter minst tre provtillfällen (inklusive ordinarie provtillfälle) enligt föreskrifterna i den kursplan som studenten ursprungligen varit kursregistrerad på under en tid av maximalt två år från det att tidigare kursplan upphört att gälla eller kursen slutat erbjudas.