Jag studerar genetiken hos Puumalavirus i Sverige för att bättre förstå virusets genetiska mångfald.
Jag är doktorand i Anne Tuiskunen Bäck lab. Puumalavirus (PUUV) finns i hela Europa men är högendemiskt i norra Sverige, där det orsakar Nephropathia epidemica (NE) — en mild form av hemorragisk feber med njurpåverkan, även kallad sorkfeber. Skogssorken (Myodes glareolus) är den primära reservoaren, och smitta till människa sker via inandning av luftburna viruspartiklar. Cykliska fluktuationer i sorkpopulationer driver NE-incidensen, och det största utbrottet i Sverige var 2006–2007.
PUUVs genetiska variation i relation till utbrott är fortfarande okänd, eftersom sekvensering främst har fokuserat på korta delar av virusgenomet eller gjorts på cellodlat virus. Vår grupp tog nyligen fram ett så kallat target-capture sekvenseringsprotokoll och sekvenserade framgångsrikt kompletta PUUV vildtypsgenom från både humana- och sorkisolat. Vi ämnar nu utforska den genetiska mångfalden av PUUV över både tidsmässiga och rumsliga dimensioner för att bättre förstå vilka genotyper som cirkulerar och om vissa genotyper är mer benägna att orsaka utbrott.