Europeiska CBRNE-centret är sammansatt av sex partnerorganisationer; Umeå universitet, Umeå kommun, Region Västerbotten, Totalförsvarets skyddscentrum, Totalförsvarets forskningsinstitut, samt Fortifikationsverket. Centrets partnerorganisationer bidrar till verksamheten och de olika projekten med sin infrastruktur och sin expertis. Centrets styrgrupp utgörs av representanter från samtliga partner.