Forskargrupp Min forskningsverksamhet är primärt fokuserad på att identifiera metabola markörer för neurodegenerativa sjukdomar i blod och ryggmärgsvätska. Detta kan öka förståelsen för de molekylära mekanismerna som ligger bakom sjukdomar såsom Parkinsons och Alzheimers sjukdom, underlätta diagnostik och leda till nya behandlingsstrategier. Kvantifiering av metaboliter utförs med metoderna kärnmagnetisk resonans (NMR) spektroskopi och mass spektrometri.
Klinisk metabolomik för studier av neurodegeneration.
Trots intensiva forskningsinsatser är sjukdomsmekanismerna för flera neurodegenerativa sjukdomar, såsom Parkinsonism och demens, inte helt klarlagda och behandlingsalternativ saknas i hög grad. För att identifiera metabolitmarkörer, påverkade metabola vägar och möjliga sjukdomsmekanismer för dessa sjukdomar används kärnmagnetisk resonansspektroskopi (NMR) och masspektrometri (MS) för analys av metabolomet i cerebrospinalvätska (CSF) och blodprover, där prover samlats in longitudinellt från patienter med Parkinsonism och demens. Syftet är att identifiera och validera biomarkörer för dessa sjukdomar, vilka potentiellt kan överföras till klinik och användas för framtida diagnostik.
Fragmentscreening och strukturbiologi.
Läkemedelsutveckling genom NMR-baserad fragmentscreening är en mindre del av forskningsverksamheten, där ett internt fragmentbibliotek används för screening mot olika målproteiner. För att bestämma strukturerna och karaktärisera proteinernas bindningsepitoper används två- och tredimensionell NMR-spektroskopi samt röntgenkristallografi.
Pågående projekt
Longitudinella studier av Parkinsonism
Diagnos av Parkinsons sjukdom (PS) kan vara utmanande, och särskilt i ett tidigt skede av sjukdomen är det svårt att skilja PS från de atypiska Parkinsonismsjukdomarna multipel systematrofi (MSA) och progressiv supranukleär pares (PSP).
CSF- och plasmaprover från 186 Parkinsonismpatienter, tagna vid diagnos och upp till 10 år efter diagnos, erhölls från den longitudinella biobanken Ny Parkinsonism i Umeå (NYPUM) och analyserades med NMR-spektroskopi. Genom multivariat statistik och bioinformatik kommer metabolomet att karaktäriseras och biomarkörer för PD, MSA och PSP kommer att identifieras. Denna longitudinella analys kommer att belysa viktiga metabolitförändringar under sjukdomsprogressionen vilket möjliggör analys av förändringa på både grupp- och personnivå, visa effekten av medicinsk behandling och identifiera viktiga metabolisk vägar i patogenesen av Parkinsonismsjukdomar.
Prediagnostisk biomarkörstudie av Parkinsonism
En omfattande metabolomikanalys av prover från PD-, MSA- och PSP-patienter, såväl som från matchade kontrollpersoner, utförs i syfte att identifiera biomarkörer och påverkade metaboliska vägar för PD, MSA och PSP. Detta projekt omfattar plasmaprover från en prediagnostisk kohort erhållen från biobankerna Northern Sweden Health and Disease Study (NSHDS) och NYPUM. Masspektrometri (MS) analyser, med hjälp av Biocrates MxP Quant 500-kit, kommer att kvantifiera över 600 metaboliter i 26 biokemiska klasser, och en utökad kärnmagnetisk resonans (NMR) karaktärisering av plasmaproverna kommer att kvantifiera upp till ytterligare 250 metabolit- och lipidmarkörer.
Metabolomik hos SuperAgers
I detta projekt analyserades resultaten från en tidigare metabolomikstudie av prover från Betula-studien på nytt, men med avseende på så kallade SuperAgers (personer, 80 år och äldre, som har ett minne och en kognitiv förmåga som är likavärdig som hos personer som är årtionden yngre). Intressanta effekter på de metabola processerna identifierades, och dessa resultat sammanfattas för närvarande i ett manuskript.
