Postdoktor inom "cancer neurovetenskap: påverkan av neural aktivitet på 3D-genom och cellplasticitet i glioblastom”

Beskrivning

Vi söker en motiverad postdoktor för att studera för att studera hur neural aktivitet påverkar 3D genomik, kromatinlandskap och cellulär plasticitet i glioblastom under 2 år.

Postdoktortjänsten finansieras av Consolidator Grant från SSMF (Svenska Sällskapet för Medicinsk Forskning).  Forskargruppen är anknuten till Wallenberg Centrum för Molekylär Medicin vid Umeå Universitet (WCMM). WCMM grundades som en del av en nationell satsning av Knut och Alice Wallenbergs Stiftelse (KAW) för att stärka life science-forskningen i Sverige. WCMM vid Umeå universitet bygger på ett nära samarbete med Region Västerbotten, övriga WCMM centra i Sverige samt SciLifeLab.

Forskargruppen är baserad på Institutionen för medicinsk och translationell biologi vid Umeå Universitet. Vid institutionen finns stark forskning inom cancer, genetik, neurovetenskap, metabolism och imaging. Centret har tillgång till god infrastruktur och är väl utrustat med nödvändig instrumentering. I laboratoriet finns en stark bakgrund i genreglering och 3D-kromatinorganisation i glioblastom, epigenetik, bioinformatik och grundläggande cancerforskning. Vi söker en entusiastisk och motiverad postdoktor till Silvia Remeseiros forskningsgrupp för att, inom ramen för Cancer Neurovetenskap, studera hur signaler från neuroner påverkar 3D genomorganisation och cellulär plasticitet i glioblastom.

Projektbeskrivning

Under de senaste åren har forskning visat att neuroner aktivt påverkar cancerutvecklingen genom att signalera till tumörceller och driva tumörtillväxt. En central mekanism är neurogliomala synapser som förmedlar neuronal aktivitet till glioblastomceller och därigenom främjar tumörprogression. Detta kopplar direkt till våra fynd som ger mekanistisk insikt i de genreglerande nätverk som styr neuron-till-gliomkommunikation. Kromatinorganisation kontrollerar transkription genom att modulera 3D-interaktioner mellan enhancers och promotorer i cellkärnan. I vårt arbete (Chakraborty et al 2023 Nature Communications) har vi för första gången pekat på de epigenomiska och 3D-kromatinförändringar som resulterar i genuttrycksförändringar som ligger till grund för neuron-till-gliomkommunikation.

Inom ramen för projektet kommer vi att använda single-cell-sekvenseringsmetoder, bioinformatik och genomredigering, samt co-kultursystem för att modellera interaktioner mellan neuroner och gliomceller; med huvudfokus på att studera inverkan av neuronaktivitet i 3D-genomorganisation och cellulär plasticitet vid glioblastom. Med detta projekt kommer vi att fortsätta våra banbrytande studiet av genregulatoriska nätverk underliggande neurogliomala synapser.

Experimentell metodik inkluderar single-cell-sekvensering (scRNA-seq och scATAC-seq), tekniker för att definiera 3D genomorganisation (HiChIP, HiC, Capture-C) och bioinformatik. Den sökande ska kunna: 1) självständigt planera experiment, 2) bedriva forskning inom ramen för gruppens forskningsprogram, 3) etablera metoder, 4) analysera forskningsresultat, 5) kommunicera resultat och presentera data vid nationella och internationella vetenskapliga möten.

Arbetsuppgifter

Som postdoktor i projektet kommer du att arbeta med olika hel-genomsekvensering metoder (HiChIP, HiC, ChIP-seq, CUT&RUN, RNA-seq, ATAC-seq, samt scRNA- och scATAC-seq). En del av arbetet består av bioinformatik analyser, med stöd från bioinformatiker inom forskargruppen. Arbetet inkluderar också cellinjer i kultur.

Kvalifikationer

Behörig att anställas som postdoktor är den som avlagt doktorsexamen, eller utländsk examen som bedöms motsvara doktorsexamen, inom molekylärmedicin, molekylärbiologi, datavetenskap eller relaterad disciplin vid tidpunkten för rekryteringen. En stark bakgrund inom genomik är ett krav.

Tidigare erfarenhet av multi-omics tekniker är ett krav. Erfarenhet av bioinformatik är en mycket önskvärd färdighet. Kandidaten ska ha mycket goda kunskaper i engelska, såväl i tal som i skrift samt god förmåga till kommunikation.

Vi söker en begåvad och nyfiken forskare med självständigt och kritiskt tänkande som tidigare deltagit i intressant och produktiv forskning och som har förmåga att arbeta såväl självständigt som tillsammans med övriga i forskargruppen.

Meriterande

Eftersom anställning som postdoktor utgör en meriteringsanställning för juniora forskare, riktar vi oss främst till den som har en doktorsexamen som inte är äldre än tre år räknat från sista ansökningsdag. Om det finns särskilda skäl kan den komma i fråga som avlagt doktorsexamen tidigare. Med särskilda skäl avses ledighet på grund av sjukdom, föräldraledighet, klinisk tjänstgöring, förtroendeuppdrag inom fackliga organisationer eller andra liknande omständigheter, samt för ämnesområdet relevant tjänstgöring/uppdrag. Följande är också meriterade:

• Erfarenhet i bioinformatiker analyser.
• Tidigare bakgrund i neurovetenskap och/eller glioblastom.
• Publikationer inom genreglering, 3D-kromatinorganisation och/eller onkologi.

Villkor

Anställningen är en tidsbegränsad anställning på heltid 2 år enligt villkor i avtal om tidsbegränsad anställning som postdoktor. Tjänsten är fullt finansierat under 2 år, men det finns möjligheten att förlänga finansiering och kandidaten kommer också uppmuntras till att söka egna anslag. 

Mer om anställningen

Start våren 2026 eller enligt överenskommelse.

För ytterligare information, vänligen kontakta universitetslektor Silvia Remeseiro, MTB / WCMM, via silvia.remeseiro@umu.se

Mer information om gruppens forskning finns att läsa på våra webbsidor:

https://www.umu.se/institutionen-for-medicinsk-och-translationell-biologi/

https://www.umu.se/en/research/groups/silvia-remeseiro/

www.umu.se/en/wallenberg-centre-for-molecular-medicine/

https://www.umu.se/en/staff/silvia-remeseiro/

 Ansökan

Ansökan ska innehålla:

• En kort beskrivning av forskningsintressen och motivering till varför du är intresserad av anställningen.
• CV inkluderande tidigare positioner samt laboratorieteknisk expertis.
• Publikationslista
• Examensbevis från forskarutbildning samt andra relevanta examina
• Kontaktinformation till två referenspersoner

Ansökan ska vara skriven på engelska eller svenska. Ansökan ska göras via vårt e-rekryteringssystem

Varbi och vara inkommen senast den 19:e december 2025.

Välkommen med din ansökan!