Postdoktoralt stipendium (2 år) inom biokemi och molekylärbiologi
Kemiska institutionen utlyser ett postdoktoralt stipendium inom biokemi och molekylärbiologi. Stipendiet är på heltid i två år med tillträde enligt överenskommelse.
Institutionsspecifik information Värdlaboratoriet är beläget inom det tvärvetenskapliga Chemical Biological Centre (KBC) vid Umeå universitet och är knutet till det nationella excellenscentret Umeå Centre for Microbial Research (UCMR). Laboratorierna är fullt utrustade för biologisk och kemisk forskning med tillgång till utmärkta faciliteter samt toppmodern utrustning och plattformar i en kreativ, inspirerande, internationell och mycket interaktiv miljö.
Tillgängliga faciliteter inkluderar bland annat Protein Expertise Platform, röntgenkristallografi, proteomik, NMR (850–400 MHz), cryo-EM och Biochemical Imaging Centre (konfokalmikroskopi, SIM, FLIM, spinning disk, TIRF, STORM). Läs mer om life science-forskning vid Umeå universitet (video).
Projektbeskrivning Autofagi är en evolutionärt bevarad process där cellen bryter ner och återanvänder egna komponenter. Processen används främst för att eliminera eller återvinna defekta cellorganeller eller oanvända proteiner. Autofagi spelar en viktig roll i utveckling och åldrande och har kopplats till flera mänskliga sjukdomar, inklusive cancer, neurodegenerativa sjukdomar och infektioner orsakade av patogener.
Ny forskning visar att autofagimaskineriet även är involverat i flera autofagi-oberoende processer. Dessa så kallade icke-kanoniska autofagivägar (CASM) sker oberoende av delar av den centrala autofagimaskineriet och spelar en viktig roll i immunreglering och inflammation, modulering av värd-patogen-interaktioner, reglering av neuronal signalering samt immunförsvarets respons mot cancer.
Genom en kombination av cellbiologi, strukturbiologi och kemisk-genetiska metoder har vi klarlagt grundläggande mekanismer bakom bildandet av autofagosomer. Vårt laboratorium har även beskrivit en ny verkningsmekanism hos virulenta bakterier (Legionella pneumophila, Vibrio cholerae) som påverkar värdcellens autofagi (eLife 2017, JCS 2021, JCB 2022).
Vi har identifierat nya kemiska strukturer (kemotyper) för att modulera autofagi samt nya cellulära signalvägar som reglerar processen (Angew Chem 2017, Nat Chem Biol 2019, Autophagy 2021, Angew Chem 2022).
Nyligen har vi gjort nya upptäckter inom CASM. Vi identifierade den nya lysosom-riktade föreningen Inducin och den ESCRT-III-riktade föreningen Tantalosin, vilka inducerar CASM (ChemBioChem 2023, PNAS 2024). Vi upptäckte också en ny signalväg, sphingomyelin-TECPR1-inducerad ATG8-lipidering (STIL), samt TECPR1-ATG5–ATG12 som ett nytt E3-liknande ligas för ATG8-lipidering i CASM, och deras funktion i reparation av lysosommembran (EMBO Rep 2023, EMBO J 2026).
Projektet kommer att kombinera biokemiska, cellbiologiska och nya kemiska metoder för att förstå de molekylära mekanismerna bakom både kanonisk och icke-kanonisk autofagi.
Metoder som används i projektet inkluderar bland annat:
proteinuttryck och proteinrening
biokemisk karakterisering
in vitro-rekonstitution
peptidsyntes
cellavbildning
western blot
gen-knockout eller knockdow
Projektet är tvärvetenskapligt och innefattar starka samarbeten mellan olika vetenskapliga discipliner. Det tvååriga stipendiet (720 000 SEK) är skattefritt och kan påbörjas så snart som möjligt.
Kvalifikationer För att vara behörig för ett postdoktoralt stipendium ska personen ha avlagt doktorsexamen eller utländsk examen som bedöms motsvara doktorsexamen inom biokemi, kemisk biologi, molekylärbiologi, cellbiologi eller ett annat relevant område. Detta behörighetskrav ska vara uppfyllt senast vid tidpunkten då beslut om stipendiatmottagare fattas. För att vara aktuell som postdoktorstipendiat bör i första hand den komma i fråga som avlagt examen högst tre år sedan från sista ansökningsdag. Om det finns särskilda skäl kan den komma i fråga som avlagt doktorsexamen tidigare. Med särskilda skäl avses ledighet på grund av sjukdom, föräldraledighet, förtroendeuppdrag inom fackliga organisationer, tjänstgöring inom totalförsvaret, eller andra liknande omständigheter samt klinisk tjänstgöring eller för ämnesområdet relevant tjänstgöring/uppdrag.
Den framgångsrika kandidaten förväntas kunna driva sina studier självständigt men också ha nära samarbete med andra medlemmar i forskargruppen. Självständighet och god samarbetsförmåga är därför viktiga krav.
God förmåga att uttrycka sig i tal och skrift på engelska är också ett krav.
Erfarenhet av proteinuttryck och proteinrening, molekylär kloning, membranbiokemi, in vitro-rekonstitution, protein- eller peptidkemi, cellavbildning, western blot och/eller gen-knockout/knockdown är meriterande, liksom en god vetenskaplig publikationslista.
Ansökan Ansökan ska vara skriven på engelska och bifogas som en enda PDF-fil. Ansökan ska registreras via Umeå universitets e-rekryteringssystem Varbi och vara inkommen senast 17 april.
En fullständig ansökan ska innehålla
Personligt brev där du beskriver forskningsintressen, kvalifikationer och motivation för att söka stipendiet (max 2000 tecken inklusive mellanslag).
Meritförteckning - CV med publikationslista, inklusive publicerade artiklar och preprints med webblänk/DOI
Verifierad kopia av doktorsexamensbevis eller dokumentation som tydliggör när doktorsexamen förväntas erhållas,
Kopior av andra examensbevis, akademiska kursintyg och/eller betyg, som den sökande vill åberopa,
Kontaktuppgifter till två vidtalade referenser.
För närmare upplysningar kontakta Professor Yaowen Wu, yaowen.wu@umu.se.
