Andrei Chabes Lab

Forskargrupp Forskar om dNTP-metabolism och genomets stabilitet.

De fyra dNTP:erna – dATP, dTTP, dCTP och dGTP – är de grundläggande byggstenarna i DNA. En balanserad tillgång och korrekt total koncentration av dessa molekyler är avgörande för en trogen kopiering av arvsmassan vid celldelning. Eftersom dNTP-nivåerna varierar under cellcykeln krävs en noggrant reglerad produktion, som styrs genom flera samverkande mekanismer.

I vår forskning studerar vi:

1. Hur genomintegritetskontrollen reglerar dNTP-koncentrationerna – och hur dNTP-nivåerna i sin tur påverkar aktiveringen av genomintegritetskontrollen.
2. Hur obalanserade dNTP-pooler påverkar replikationens noggrannhet och genomets stabilitet, samt hur olika replikationsfel upptäcks och repareras.

Vi vill förstå hur förändringar i dNTP-balansen påverkar biologiska processer som åldrande och uppkomst av cancer och andra genetiska sjukdomar. På sikt är målet att utveckla nya behandlingsstrategier där man med precision kan påverka dNTP-nivåerna för att förebygga eller motverka sjukdom.

Urval av senaste publikationer:

Nathan WJ, Chen C, Sakr R, Siqueira Mietto B, van Batenburg V, van den Berg J, Wlaschin JJ, Livak F, Callen E, Wong N, Lloyd EYH, Silberberg H, Sharma S, Chari R, Freeman T, Kim B, van Oudenaarden A, Chesler AT, Ward ME, Boxer LD, McHugh PJ, Chabes A, Le Pichon CE, Nussenzweig A (2026) DNA repair drives cisplatin-induced neuronal death. Cell 189(13):4005-4021.e11

Awoyomi OF, Gorospe CM, Das B, Mishra P, Sharma S, Diachenko O, Nilsson AK, Tran P, Wanrooij PH and Chabes A (2025) RRM2B deficiency causes dATP and dGTP depletion through enhanced degradation and slower synthesis. PNAS 122:e2503531122. doi: 10.1073/pnas.2503531122

Tran P, Mishra P, Williams LG, Moskalenko R, Sharma S, Nilsson AK, Watt DL, Andersson P, Bergh A, Pursell ZF and Chabes A (2024) Altered dNTP pools accelerate tumor formation in mice. Nucleic Acids Res 52(20):12475-12486

Das B, Mishra P, Pandey P, Sharma S, Chabes A. (2022) dNTP concentrations do not increase in mammalian cells in response to DNA damage. Cell Metab. 34:1895-1896

Wanrooij PH, Tran P, Thompson LJ, Carvalho G, Sharma S, Kreisel K, Navarrete C, Feldberg AL, Watt DL, Nilsson AK, Engqvist MKM, Clausen AR and Chabes A (2020): Elimination of rNMPs from mitochondrial DNA has no effect on its stability. PNAS 117:14306-14313

Sushma S, Koolmeister C, Tran P, Nilsson AK, Larsson NG and Chabes A (2020): Proofreading deficiency in mitochondrial DNA polymerase does not affect total dNTP pools in mouse embryos. Nature Metabolism doi.org/10.1038/s42255-020-0264-z

Publikationslist på PubMed (senaste först) och på Google Scholar (mest citerade först).