Jonas Barandun Lab

I vår forskargrupp använder vi en kombination av in vivo-analyser, biokemi och kryo-elektronmikroskopi för att studera makromolekylära komplex av specialiserade patogena organismer. Vi vil förstå den molekylära grunden för väsentliga vägar i patogener och avslöja unika strukturella determinanter som kan fungera som nya mål för antibiotika.

Visualisering av unika molekylära maskiner som är viktiga för infektionsprocessen 

En intracellulär "livsstil" är en vanlig strategi för parasiter eftersom det ger många fördelar som tillgång till näringsämnen och undvikande av värdimmunsystemet. Denna strategi används av prokaryota och eukaryota parasiter som orsakar ett brett spektrum av sjukdomar. Vissa patogener har utvecklat unika och högspecialiserade molekylära system som gör det möjligt för dem att infektera, kvarstå, gömma sig och föröka sig i en värdcell.

Vi är särskilt intresserade av mycket divergerande och specialiserade patogener som har unika sätt att infektera värdceller. Vi strävar efter att identifiera och karakterisera dessa processer och att tillhandahålla en molekylär och strukturell grund för specialiserade infektionsmekanismer.

Organismspecifika element i universellt bevarade sammansättningar

Många molekylära maskiner bevaras i alla levande organismer. Ribosomen är till exempel ansvarig för nästan all proteinsyntes på jorden och väsentlig i alla levande organismer. Denna betydelse belyses av det faktum att många antibiotika riktar sig mot denna viktiga makromolekylära RNA-proteinsammansättning. Trots deras välbevarade centrala roll i alla celler skiljer sig ribosomer av olika organismer åt när det gäller deras komplexa strukturella sammansättning.

Vi vill ta reda på hur evolutionen har format ribosomens struktur och sammansättning i mycket divergerande och försummade organismer och karakterisera patogenspecifika skillnader. Vidare skulle vi vilja ta reda på om dessa skillnader kräver en organismspecifik monteringsprocess och ger en strukturell grund för syntes av ribosomer hos patogena organismer.