Doktorand i medicinsk vetenskap inom oralt mikrobiom och mikrobiell ekologi

Du som antas till utbildning på forskarnivå vid Medicinska fakulteten ingår i det fakultetsgemensamma forskarutbildningsprogrammet. Programmet omfattar 25 hp och erbjuds i två studietakter: 25 hp över 8 terminer (totalt 4 år) respektive över 12 terminer (totalt 6 år), med programstart varje höst- och vårtermin. Mer information om programmet går att finna på fakultetens hemsida för utbildning på forskarnivå (Utbildning på forskarnivå)

Projektbeskrivning och arbetsuppgifter

Är du biomedicinsk analytiker och intresserad av experimentell forskning inom mikrobiologi, molekylärbiologi och mikrobiom? Vill du undersöka hur mänsklig genetisk variation påverkar det orala mikrobiomet och bidra till ökad förståelse av mekanismer bakom hälsa och sjukdom?

Vi erbjuder nu en doktorandanställning inom ramen för den nationella forskarskolan BioLabX i ett forskningsprojekt med titeln ”oralt mikrobiom – värdgenetik och mikrobiell ekologi”. Projektet kombinerar human genetik, mikrobiologi, molekylärbiologi och mikrobiomanalys för att förstå hur värdens genetiska förutsättningar formar det orala mikrobiella ekosystemet.

Nationell forskarskola för biomedicinska analytiker

Umeå universitet deltar i forskarskolan Biomedicinsk analytiker för eXcellens (BioLabX), en nationell forskarskola som är ett samarbete mellan sju svenska lärosäten med Uppsala universitet som huvudansvarigt lärosäte.

Doktoranderna kommer att ingå i ett nationellt nätverk tillsammans med övriga doktorander inom forskarskolan. Utbildningen omfattar bland annat pedagogik, metodutveckling, handledning, projektledning och bedömning av kliniska moment. Doktoranden kommer även att delta i undervisning vid Umeå universitet, vilket ger möjlighet att utveckla en bred pedagogisk kompetens.

Projektbeskrivning

Det orala mikrobiomet utgör ett komplext och dynamiskt mikrobiellt ekosystem som spelar en central roll för oral och systemisk hälsa. Mikroorganismernas sammansättning och funktion påverkas av både den omgivande miljön och värdens biologiska förutsättningar. 

Genetiska faktorer hos människan kan förklara en betydande del av variationen i förekomsten av vissa orala mikroorganismer. Trots detta är de biologiska mekanismerna bakom dessa samband fortfarande i stor utsträckning okända. 

Nya omfattande genetiska associationsstudier har identifierat specifika genetiska loci hos människan som är kopplade till variation i det orala mikrobiomet. Dessa fynd skapar nya möjligheter att gå från statistiska associationer till en förståelse av de funktionella mekanismer som kopplar värdens genetik till mikrobiell ekologi.

Projektet "oralt mikrobiom – värdgenetik och mikrobiell ekologi" fokuserar på hur genetiskt bestämda variationer i exempelvis salivens sammansättning, glykanpresentation och värdvävnader påverkar mikroorganismers adhesion, biofilmbildning och funktion. Målet är att identifiera och karakterisera de mekanismer genom vilka värden formar det orala mikrobiella ekosystemet. 

Projektet kombinerar experimentella och bioinformatiska angreppssätt och arbetet kommer bland annat omfatta: 

• genetiska och molekylärbiologiska analyser,
• Nanopore-baserad sekvensering,
• analys och integration av mikrobiomdata och kliniska data,
• experimentella studier av mikrobiell adhesion och biofilmbildning,
• analys av kolhydrater och proteiner med relevans för värd–mikrob-interaktioner,
• proteinprofilering av extracellulära/yttre membranvesiklar.

Som doktorand kommer du att få möjlighet att utveckla kompetens inom flera kompletterande metodområden och successivt ta ett självständigt ansvar för delar av forskningsprojektet.

Antagningskrav

För att antas till utbildning på forskarnivå ska den sökande ha grundläggande behörighet och särskild behörighet enligt nedan samt bedömas ha sådan förmåga som i övrigt behövs för att klara utbildningen.

Grundläggande behörighet

Grundläggande behörighet till utbildning på forskarnivå har den som har avlagt en examen på avancerad nivå, fullgjort kursfordringar om minst 240 högskolepoäng (hp), varav minst 60 hp på avancerad nivå, eller som i någon annan ordning inom eller utom landet har förvärvat i huvudsak motsvarande kunskaper (HF 7 kap 39§). Behörighetskraven måste vara uppfyllda vid antagningstillfället, men behöver inte vara uppfyllda när ansökan skickas in.

Särskild behörighet

För att kunna antas till utbildning på forskarnivå krävs att den sökande har nödvändiga kunskaper från högskoleutbildning eller motsvarande utbildning som bedöms i relation till forskarutbildningsområdet samt nödvändiga språkkunskaper i engelska. För den aktuella tjänsten krävs avlagd biomedicinsk analytikerexamen som kompletterats med en masterutbildning. Både skriftliga och muntliga språkkunskaper avses. Bedömning av dessa kunskaper görs genom att ansökan skrivs på engelska och delar av intervjun hålls på engelska.

Övriga kvalifikationer

Vi söker dig som: 

• har ett starkt intresse för experimentell forskning.
• arbetar noggrant och systematiskt och har god problemlösande förmåga,
• har förmåga att arbeta både självständigt och tillsammans med andra.

Meriterande

Det är meriterande med erfarenhet av och/eller kunskap inom: 

• mikrobiota- och mikrobiomanalys,
• sekvensering och analys av sekvensdata,
• PCR och TaqMan-baserade analyser,
• molekylärbiologiska och mikrobiologiska laboratoriemetoder,
• grundläggande programmering eller bioinformatik,
• arbete med kliniska eller biomedicinska data.

Hänsyn tas även till hur den sökandes tidigare utbildning och erfarenheter bedöms ge goda förutsättningar att genomföra forskarutbildningen och utvecklas som självständig forskare.  

Stor vikt kommer att läggas på personlig lämplighet. Hänsyn tas även till referenstagning, anställningsintervju och annan möjlig prövning av huvudkandidater. 

Anställningsvillkor

Arbetsplatsen är vid Institutionen för odontologi, där den ämnesspecifika utbildningen och handledningen bedrivs. Anställningen är en doktorandanställning på heltid under fyra år eller på deltid motsvarande upp till fem år. 

Ansökan 

Ansökan ska göras via vårt e-rekryteringssystem Varbi och vara inkommen senast 15 oktober 2026. 

Den sökande till utbildning på forskarnivå ska lämna in en skriftlig ansökan på engelska. En fullständig ansökan ska innehålla:

1. Personligt brev som sammanfattar ditt vetenskapliga intresse och motiverar varför du söker tjänsten (max 2 sidor)
2. CV/meritförteckning
3. Examensbevis för biomedicinsk analytikerexamen samt examensbevis för kompletterande masterutbildning
4. Uppsatser/övriga publikationer. 
5. Ev. övriga meriter med relevans för anställning.
6. Kontaktuppgifter till två referenspersoner. 

Observera att ofullständig ansökan inte kommer att behandlas. Enligt Högskoleförordningen (12 kap 2§) kan beslutet om anställning inte överklagas.

Övrig information

Närmare upplysningar lämnas av Anders Esberg, anders.esberg@umu.se, 070–6295572.

Löneplacering

Lön i enlighet med fastställd lönestege för doktorandbefattningar. https://www.umu.se/regelverk/personal-lika-villkor-och-arbetsmiljo/doktorandavtal-2025-10-01-2026-10-01/ 

Välkommen med din ansökan!