Bild: Mattias Pettersson
Bild: Mattias Pettersson
Forskargrupp Forskar om dNTP-metabolism och genomets stabilitet.
De fyra dNTP:erna – dATP, dTTP, dCTP och dGTP – är de grundläggande byggstenarna i DNA. En balanserad tillgång och korrekt total koncentration av dessa molekyler är avgörande för en trogen kopiering av arvsmassan vid celldelning. Eftersom dNTP-nivåerna varierar under cellcykeln krävs en noggrant reglerad produktion, som styrs genom flera samverkande mekanismer.
I vår forskning studerar vi:
1. Hur genomintegritetskontrollen reglerar dNTP-koncentrationerna – och hur dNTP-nivåerna i sin tur påverkar aktiveringen av genomintegritetskontrollen.
2. Hur obalanserade dNTP-pooler påverkar replikationens noggrannhet och genomets stabilitet, samt hur olika replikationsfel upptäcks och repareras.
Vi vill förstå hur förändringar i dNTP-balansen påverkar biologiska processer som åldrande och uppkomst av cancer och andra genetiska sjukdomar. På sikt är målet att utveckla nya behandlingsstrategier där man med precision kan påverka dNTP-nivåerna för att förebygga eller motverka sjukdom.
Awoyomi OF, Gorospe CM, Das B, Mishra P, Sharma S, Diachenko O, Nilsson AK, Tran P, Wanrooij PH and Chabes A (2025) RRM2B deficiency causes dATP and dGTP depletion through enhanced degradation and slower synthesis. PNAS 122:e2503531122. doi: 10.1073/pnas.2503531122
Tran P, Mishra P, Williams LG, Moskalenko R, Sharma S, Nilsson AK, Watt DL, Andersson P, Bergh A, Pursell ZF and Chabes A (2024) Altered dNTP pools accelerate tumor formation in mice. Nucleic Acids Res 52(20):12475-12486
Das B, Mishra P, Pandey P, Sharma S, Chabes A. (2022) dNTP concentrations do not increase in mammalian cells in response to DNA damage. Cell Metab. 34:1895-1896
Wanrooij PH, Tran P, Thompson LJ, Carvalho G, Sharma S, Kreisel K, Navarrete C, Feldberg AL, Watt DL, Nilsson AK, Engqvist MKM, Clausen AR and Chabes A (2020): Elimination of rNMPs from mitochondrial DNA has no effect on its stability. PNAS 117:14306-14313
Sushma S, Koolmeister C, Tran P, Nilsson AK, Larsson NG and Chabes A (2020): Proofreading deficiency in mitochondrial DNA polymerase does not affect total dNTP pools in mouse embryos. Nature Metabolism doi.org/10.1038/s42255-020-0264-z
Publikationslist på PubMed (senaste först) och på Google Scholar (mest citerade först).
Andrei Chabes, professor vid Umeå universitet, har valts in som ledamot i Kungliga Vetenskapsakademien.
Redan en måttlig obalans av byggstenar för arvsmassan kan ge upphov till cancer, visar avhandling.
Byggstenar för RNA, som hamnar i mitokondrie-DNA bidrar inte till åldrandet, visar ny studie på möss.
