Laura Carroll tilldelas “Framtidens Forskningsledare” – får 15 miljoner kronor för att studera mikrobiom på singel-cell nivå

Laura Carroll, biträdande universitetslektor vid Institutionen för klinisk mikrobiologi och fellow vid SciLifeLabs Data-Driven Life Science (DDLS) i Umeå.

BildHans Karlsson

Jag har aldrig varit på en plats som är så välkomnande och samarbetsinriktad, och det är denna miljö som gör spännande forskning som denna möjlig 

Laura Carroll är en av 16 forskare som valts ut bland 213 sökande för “Framtidens Forskningsledare”, som ger forskningsstöd om 15 miljoner kronor under fem år, inklusive en gedigen ledarskapsutbildning för att stötta lovande forskningsledare.
– Jag är väldigt förväntansfull eftersom jag aldrig tidigare har fått någon formell ledarskapsutbildning. Jag ser fram emot att lära mig nya idéer, tekniker och färdigheter, säger Laura Carroll, biträdande universitetslektor vid Institutionen för klinisk mikrobiologi och fellow inom SciLifeLabs Data-Driven Life Science (DDLS) i Umeå. 

Hennes projekt, “Maximal upplösning av mikrobiom på enstaka cellers nivå”, syftar till att ge mikrobiologer metoder för att sekvensera genomet i varje enskild cell i ett mikrobiom, vilket gör det möjligt att med maximal upplösning avgöra vilka arter eller stammar som finns där och vilka gener de bär på.
– Det är en grundläggande fråga inom mikrobiomforskning, men det är väldigt svårt att besvara eftersom dagens metoder saknar tillräcklig upplösning och/eller kapacitet, förklarar Laura Carroll.

För att övervinna dessa utmaningar har hennes forskargrupp, tillsammans med forskarkollegor vid Umeå universitet, inklusive Johan Henrikssons grupp, nyligen utvecklat en ny metod som kan generera upp till en miljon bakteriella genom från ett enda prov. Denna metod, tillgänglig som preprint, ger en oöverträffad upplösning som kan förändra hur mikrobiom studeras.
– Med stöd från SSF kommer vi nu att ta metoden till nästa nivå genom att utveckla nya beräkningsmetoder som kan hantera de enorma datamängderna.

Laura Carroll samarbetar med Johan Henrikssons forskningsgrupp inom sitt projekt.

BildMattias Pettersson

Hon hoppas att de metoder som utvecklas i projektet ska ge mikrobiologer insikter i mikrobiom med maximal upplösning, vilket i sin tur kan förbättra behandling och övervakning av infektionssjukdomar samt vid till utvecklandet av mikrobiombaserad diagnostik och terapi. 
– Det här bidraget kommer verkligen i rätt tid, tillägger hon. Hittills har våra team gjort stora framsteg genom att slå ihop våra resurser, men för att ta arbetet vidare behöver vi växa. SSF:s stöd gör det möjligt för oss att utöka teamet och utveckla våra metoder ännu mer. 

Laura Carroll lyfter också fram atmosfären vid Umeå universitet som en nyckelfaktor för projektets framgång: 
– Jag älskar hur samarbetsvilliga forskarna vid Umeå universitet är! Jag har aldrig varit på en plats som är så välkomnande och samarbetsinriktad, och det är denna miljö som gör spännande forskning som denna möjlig.