Hoppa direkt till innehållet
printicon
Huvudmenyn dold.
Personalbild Fredrik Almqvist

Fredrik Almqvist

Jag är professor i organisk kemi och min forskargrupp letar nya lösningar för infektions- och neurodegenerativa sjukdomar. Jag är också biträdande föreståndare för Umeå Centre for Microbial Research.

Verksam vid

Anknytning
Professor vid Kemiska institutionen
Plats
KB.C4, Linnaeus väg 10, (rum: B4.37.07) Umeå universitet, 901 87 Umeå

Min forskning fokuserar på metodutveckling inom organisk syntes och design och syntes av molekyler som interagerar med makromolekyler, särskilt hämning av proteinproteininteraktioner. Exempel på det senare är utveckling av hämmare av bakteriell makromolekylär montering och amyloidformation. Min forskningsgrupp har banat väg för design och syntes av ring-smälta 2-pyridonföreningar som peptidomimetik och tillsammans med Dr. Hultgrens labb vid Washington University i St. Louis visat att dessa mimetiska mönster är idealiska för utveckling av antivirulensföreningar.

Vi har utvecklat små molekyler som kallas "pilicider" som hämmar chaperone-usher pathway (CUP) pili, som är viktiga virulensfaktorer hos uropatogent E. coli (UPEC) och detta har resulterat i en djupare förståelse för reglering av CUP pili biosyntes och UPEC:s förmåga att etablera biofilmsbildning. Tillsammans med Dr. Chapman vid University of Michigan FA har vi vidare studerat en delmängd av piliciderna som kallas "curlicider" som är beroende av substitutionsmönstret på det centrala fragmentet har förmågan att påverka curli-monteringen i E. coli. Dessa föreningar är utmärkta verktyg i strävan efter en större förståelse för mekanismerna bakom amyloidmontering i allmänhet men curlimontering i synnerhet. Både pili och curli är viktiga beståndsdelar i olika bakteriella biofilmer och gruppen har ett allmänt intresse av att utveckla biofilmshämmare.

I detta sammanhang startade jag för några år sedan ett samarbete med Dr. Christina Stallings vid Washington University i St. Louis för att utveckla sin upptäckt av mycobakteriella toleranshämmare (MTI:er) och undersöka och förstå det exakta verkningssättet för MTI:er. Dessa nya föreningar har stor potential att förbättra behandlingssätten för tuberkulos, den dödligaste smittsamma infektionssjukdomen i världen. Det breda utbudet av hämmare som har utvecklats i labbet har lett till flera tvärvetenskapliga samarbeten och bland dessa har jag pågående forskning med UCMR-forskare Dr. Sven Bergström och Åsa Gylfe (Klamydia), Jörgen Johansson och Elisabeth Sauer-Eriksson (Listeria) och Johan Normark (Tuberkulos) i syfte att förbättra effektiviteten och dissekera exakta handlingssätt.

ARKIVOC, Arkat 2021, Vol. 2020, (7) : 365-378
Cairns, Andrew G.; Sarkar, Souvik; Singh, Pardeep; et al.
Antimicrobial Agents and Chemotherapy, American Society for Microbiology 2021, Vol. 65, (5)
Núñez-Otero, Carlos; Bahnan, Wael; Vielfort, Katarina; et al.
Scientific Reports, Springer Nature 2021, Vol. 11, (1)
Tükenmez, Hasan; Sarkar, Souvik; Anoosheh, Saber; et al.
Journal of Organic Chemistry, American Chemical Society (ACS) 2020, Vol. 85, (21) : 14174-14189
Adolfsson, Dan E.; Tyagi, Mohit; Singh, Pardeep; et al.
mBio, American Society for Microbiology 2020, Vol. 11, (6)
Reithuber, Elisabeth; Nannapaneni, Priyanka; Rzhepishevska, Olena I; et al.
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, The National Academy of Scionces of the United States of America 2019, Vol. 116, (21) : 10510-10517
Flentie, Kelly; Harrison, Gregory A.; Tükenmez, Hasan; et al.
MedChemComm, Royal Society of Chemistry 2019, Vol. 10, (11) : 1966-1987
Kulén, Martina; Núñez-Otero, Carlos; Cairns, Andrew G.; et al.
Brain, behavior, and immunity, Elsevier 2019, Vol. 80 : 525-535
Olsen, Laura K.; Cairns, Andrew G.; Ådén, Jörgen; et al.
Angewandte Chemie International Edition, John Wiley & Sons 2019, Vol. 58 : 8577-8580
Petzold, Daniel; Singh, Pardeep; Almqvist, Fredrik; et al.
Journal of Organic Chemistry, American Chemical Society (ACS) 2019, Vol. 84, (7) : 3887-3903
Singh, Pardeep; Adolfsson, Dan E.; Ådén, Jörgen; et al.
Organic Letters, American Chemical Society (ACS) 2019, Vol. 21 : 6946-6950
Singh, Pardeep; Cairns, Andrew G.; Adolfsson, Dan E.; et al.
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, Washington: Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America (PNAS) 2019, Vol. 116, (13) : 6463-6472
Vain, Thomas; Raggi, Sara; Ferro, Noel; et al.
ACS Chemical Neuroscience, American Chemical Society (ACS) 2018, Vol. 9, (11) : 2542-2547
Cairns, Andrew G.; Vazquez-Romero, Ana; Mahdi-Moein, Mohammad; et al.
Journal of Medicinal Chemistry, American Chemical Society (ACS) 2018, Vol. 61, (9) : 4165-4175
Kulén, Martina; Lindgren, Marie; Hansen, Sabine; et al.
Nature Microbiology, NATURE PUBLISHING GROUP 2018, Vol. 3, (12) : 1362-1368
Omattage, Natalie S.; Deng, Zengqin; Pinkner, Jerome S.; et al.
Current Organocatalysis, Bentham Science Publishers 2017, Vol. 4, (1) : 48-61
Basu, Basudeb; Paul, Susmita; Kundu, Samir; et al.
Journal of Medicinal Chemistry, American Chemical Society (ACS) 2017, Vol. 60, (22) : 9393-9399
Good, James A. D.; Kulén, Martina; Silver, Jim; et al.
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, Vol. 114, (46) : 12184-12189
Jain, Neha; Ådén, Jörgen; Nagamatsu, Kanna; et al.
PLOS ONE, Vol. 12, (9)
Pokrzywa, Malgorzata; Pawelek, Katarzyna; Kucia, Weronika Elzbieta; et al.
Tetrahedron Letters, Elsevier 2017, Vol. 58, (34) : 3350-3352
Wixe, Torbjörn; Almqvist, Fredrik
Organic Letters, Vol. 18, (24) : 6228-6231
Barange, Deepak Kumar; Johnson, Magnus T.; Cairns, Andrew G.; et al.
Cell chemical biology, Vol. 23, (3) : 404-414
Good, James A. D.; Andersson, Christopher; Hansen, Sabine; et al.
Journal of Medicinal Chemistry, American Chemical Society (ACS) 2016, Vol. 59, (5) : 2094-2108
Good, James A. D.; Silver, Jim; Núñez-Otero, Carlos; et al.
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, Vol. 113, (51) : 14733-14738
Hall, Michael; Grundström, Christin; Begum, Afshan; et al.
mBio, Vol. 7, (2)
Shaffer, Carrie L.; Good, James A. D.; Kumar, Santosh; et al.
Oncogene, Nature Publishing Group 2016, Vol. 35, (48) : 6262-6269
Varga, M G; Shaffer, C L; Sierra, J C; et al.
Parkinson's Disease, Vol. 1
Chermenina, Maria; Chorell, Erik; Pokrzywa, Malgorzata; et al.
PLOS ONE, Vol. 10, (10) : 1-11
Chorell, Erik; Andersson, Emma; Evans, Margery L.; et al.
International Journal of Medical Microbiology, Vol. 305, (3) : 378-382
Engström, Patrik; Bergström, Malin; Alfaro, Astrid C.; et al.
mBio, Vol. 6, (1)
Engström, Patrik; Krishnan, K. Syam; Ngyuen, Bidong D.; et al.
Molecular Cell, Vol. 57, (3) : 445-455
Evans, Margery L.; Chorell, Erik; Taylor, Jonathan D.; et al.
PLoS Pathogens, Vol. 11, (3)
Floyd, Kyle A.; Moore, Jessica L.; Eberly, Allison R.; et al.
Scientific Reports, Springer 2015, Vol. 5
Perdersen, Martin Nors; Fodera, Vito; Horvath, Istvan; et al.
Organic Letters, American Chemical Society (ACS) 2015, Vol. 17, (24) : 6194-6197
Singh, Pardeep; Chorell, Erik; Krishnan, K Syam; et al.
Organic and biomolecular chemistry, Vol. 12, (12) : 1942-1956
Dang, Hung The; Chorell, Erik; Uvell, Hanna; et al.
mBio, Vol. 5, (6) : UNSP e02038-
Greene, Sarah E.; Pinkner, Jerome S.; Chorell, Erik; et al.
ChemMedChem, Vol. 9, (10) : 2309-2326
Horvath, Dragos; Lisurek, Michael; Rupp, Bernd; et al.
Marine Drugs, MDPI 2014, Vol. 12, (2) : 799-821
Strand, Mårten; Carlsson, Marcus; Uvell, Hanna; et al.
Chemistry and Biology, Elsevier 2013, Vol. 20, (10) : 1245-1254
Andersson, Emma K.; Bengtsson, Christoffer; Evans, Margery L.; et al.
Abstracts of Papers of the American Chemical Society, Vol. 245
Bengtsson, Christoffer; Chorell, Erik; Krishnan, Syam; et al.
Chemistry - A European Journal, Vol. 19, (30) : 9916-9922
Bengtsson, Christoffer; Nelander, Hanna; Almqvist, Fredrik
Archives of Biochemistry and Biophysics, Elsevier 2013, Vol. 532, (2) : 84-90
Horvath, Istvan; Sellstedt, Magnus; Weise, Christoph; et al.
Organic Letters, Vol. 15, (1) : 54-57
Hussain, Munawar; Banchelin, Thomas Sainte-Luce; Andersson, Hans; et al.
Journal of Organic Chemistry, American Chemical Society (ACS) 2013, Vol. 78, (23) : 12207-12213
Krishnan, K. Syam; Bengtsson, Christoffer; Good, James A. D.; et al.
European Journal of Organic Chemistry, John Wiley & Sons 2013, Vol. 2013, (33) : 7476-7479
Sellstedt, Magnus; Dang, Hung The; Prasad, G. Krishna; et al.
European Journal of Medicinal Chemistry, Elsevier 2012, Vol. 54 : 637-646
Bengtsson, Christoffer; Lindgren, Anders EG; Uvell, Hanna; et al.
Bioorganic & Medicinal Chemistry, Elsevier 2012, Vol. 20, (9) : 3128-3142
Chorell, Erik; Pinkner, Jerome S; Bengtsson, Christoffer; et al.
Chemistry - A European Journal, Berlin: Wiley-VCH Verlagsgesellschaft 2012, Vol. 18, (15) : 4522-4532
Chorell, Erik; Pinkner, Jerome S; Bengtsson, Christoffer; et al.
Journal of Molecular Biology, Elsevier 2012, Vol. 422, (3) : 376-389
Hammer, Neal D; McGuffie, Bryan A; Zhou, Yizhou; et al.
Journal of the American Chemical Society, American Chemical Society (ACS) 2012, Vol. 134, (7) : 3439-3444
Horvath, Istvan; Weise, Christoph F; Andersson, Emma K; et al.

Forskargrupper

Forskningsledare
Fredrik Almqvist Lab

Filmade föreläsningar:

Vetenskapslunch: Antibiotikaresistens – är slaget förlorat?

Vetenskapslunch 6 oktober 2016.